第三方物流信息系统在提供物流成本的分析和控制功能方面，可以采取以下几种方法：
数据收集和整合：第三方物流信息系统可以通过与供应商、运输公司和仓库等合作伙伴进行数据的实时交互，收集和整合与物流相关的数据，包括运输成本、仓储成本、包装成本等。同时，系统还可以将这些数据与销售、库存等其他关键数据进行整合，形成全面的物流成本信息。
成本分析功能：系统可以对物流成本进行详细分析，包括各个环节的成本、各个产品的成本、各个地区的成本等。通过对成本的精细分析，可以找出成本的主要来源和影响因素，帮助管理者了解物流成本的结构和变动趋势。
成本控制功能：系统可以提供成本控制的功能，包括设定成本目标、制定成本控制策略、监控成本执行情况等。通过设定合理的成本目标和制定科学的控制策略，可以有效地控制物流成本的增长，提高物流成本的效益。
成本模拟和优化功能：系统可以根据不同的情况进行成本模拟和优化，帮助管理者做出更合理的决策。例如，可以模拟不同的运输方案，比较它们的成本差异，选择最优的方案；可以模拟不同的仓储策略，比较它们的成本效益，选择最优的策略。
实时监控和预警功能：系统可以实时监控物流成本的执行情况，及时发现异常情况，并提供预警功能。例如，当某个物流环节的成本超出预期范围时，系统可以自动发送预警信息给相关责任人，以便及时采取措施进行调整和控制。
综上所述，第三方物流信息系统通过数据的收集和整合、成本的分析和控制、模拟和优化、实时监控和预警等功能，可以为管理者提供物流成本的全面分析和有效控制，帮助企业实现物流成本的最小化和效益的最大化。